GeT-Biopuces

Plateforme de génomique et transcriptomique.
Séquençage et PCR digitale.

Expertise

Conseil et prestation de service

Du contrôle qualité à l'analyse de données

Transfert de compétences

Ambassadeur Microbiologie au sein de la plateforme régionale GeT

Plus de 20 ans d'expérience

Recherche & Développement

Veille technologique et scientifique

Collaboration et partenariat

Accord de confidentialité

Développement méthodologique selon vos besoins

Hébergement de projets


Notre environnement

Pour le secteur public et privé

Local et international

Membre d'infrastructure de recherche IBISBA


Certifiée ISO-9001 et NFX50-900

Contactez nous

Qui sommes-nous ?

Créée en 1999 et actuellement dirigée par Marie Ange Teste, la Plateforme technologique de recherche GeT-Biopuces est l'une des premières plateformes de la Génopôle Toulouse Midi Pyrénées. Elle est hébergée au sein du Toulouse Biotechnolgy Institute à l’INSA de Toulouse

Labellisée IBISA et certifiée ISO 9001 depuis 2010, la plateforme a une activité de prestation de services et/ou collaboration (R&D) dans le domaine de la transcriptomique et de la génomique. Elle met à disposition son expertise et possède les outils pour le séquençage, l’étude sur microarrays et l’analyse des données bioinformatiques et statistiques. Grâce au savoir-faire de son équipe pluridisciplinaire, vous êtes accompagnés tout au long de la réalisation de vos projets depuis leur conception jusqu'à la mise à disposition des données brutes ou traitées. De nombreux partenaires académiques (INRAE, CNRS, INSERM, IFREMER...) et privés nous ont fait confiance pour collaborer sur des projets de recherche fondamentale ou appliquée, dans des domaines variés tels que la microbiologie, les biotechnologies, l'agroalimentaire, la santé et l'environnement. Les questions de propriété intellectuelle et les accords de confidentialité peuvent être discutés avec le service juridique de l'INSA.

La plateforme GeT-Biopuces est membre des infrastructures nationale et européenne en biotechnologie, IBISBA-FR et IBISBA (Industrial Biotechnology Innovation and Synthetic Biology Accelerator). Elle est associée à trois autres sites toulousains pour former la plateforme GeT (Génome et Transcriptome de GenoToul). Ainsi, cette plateforme multisite vous apporte l’une des offres les plus complètes de France dans le domaine de la génomique et de la transcriptomique : les puces à ADN Agilent, le séquençage haut débit petits et longs fragments, le séquençage sur cellule unique, la transcriptomique spatiale, la PCR digitale, l’analyse de données bioinformatique et statistique.


Services

Pourquoi travailler avec nous ?

La plateforme vous propose les prestations suivantes:

Pour tout renseignement sur l’une ou l’autre de nos activités, n’hésitez pas à nous contacter.

Pour en savoir plus sur notre façon de fonctionner, nous mettons à votre disposition nos recommandations (pdf).





Publications

Séguéla, A., Della-Negra, O., Gautier, R., Hamelin, J., Milferstedt, K., Servien, R., Teste, M. and Canlet, C. (2025). Integrated Co-extraction Protocol for Transcriptomic and 1H NMR Metabolomic Analysis of Multi-species Biofilms. Bio-protocol 15(5): e5237. DOI: 10.21769/BioProtoc.5237.
Cueff-Gauchard, V., J. Aube, J.-R. Lagadec, L. Bignon, J.-P. Lafontaine, I. Hernandez-Avila, N. Marsaud, et al. 2024. “FISH, a New Tool for in Situ Preservation of RNA in Tissues of Deep-Sea Mobile Fauna.” bioRxiv. doi:10.1101/2024.07.23.604794.
Alaoui, Hicham Sekkouri, Valentin Quèbre, Linda Delimi, Jérôme Rech, Roxanne Debaugny-Diaz, Delphine Labourdette, Manuel Campos, François Cornet, Jean-Charles Walter, and Jean-Yves Bouet. n.d. “In Vivo Assembly of Bacterial Partition Condensates on Circular Supercoiled and Linear DNA.” Molecular Microbiology n/a (n/a). Accessed September 13, 2024. doi:10.1111/mmi.15297.
Guicherd, M., M. Ben Khaled, M. Guéroult, J. Nomme, M. Dalibey, F. Grimaud, P. Alvarez, et al. 2024. “An Engineered Enzyme Embedded into PLA to Make Self-Biodegradable Plastic.” Nature 631 (8022): 884–90. doi:10.1038/s41586-024-07709-1.
Irlinger, Françoise, Mahendra Mariadassou, Eric Dugat-Bony, Olivier Rué, Cécile Neuvéglise, Pierre Renault, Etienne Rifa, et al. 2024. “A Comprehensive, Large-Scale Analysis of ‘Terroir’ Cheese and Milk Microbiota Reveals Profiles Strongly Shaped by Both Geographical and Human Factors.” ISME Communications 4 (1): ycae095. doi:10.1093/ismeco/ycae095.
Fayad, Nancy, Rita Barssoum, Nathalie Marsaud, Rayan Nasseredine, Nouha Abdelmalek, Souad Rouis, Marie Ange Teste, et al. 2023. “Complete Genome Sequences of Two Bacillus Thuringiensis Serovar Kurstaki Strains Isolated from Lebanon and Tunisia, Highly Toxic against Lepidopteran Larvae.” Microbiology Resource Announcements 12 (9): e00060-23. doi:10.1128/MRA.00060-23.
Guéraud, Françoise, Charline Buisson, Aurélie Promeyrat, Nathalie Naud, Edwin Fouché, Valérie Bézirard, Jacques Dupuy, et al. 2023. “Effects of Sodium Nitrite Reduction, Removal or Replacement on Cured and Cooked Meat for Microbiological Growth, Food Safety, Colon Ecosystem, and Colorectal Carcinogenesis in Fischer 344 Rats.” Npj Science of Food 7 (1): 53. doi:10.1038/s41538-023-00228-9.
Koreki, Axelle, Séverine Michel, Caroline Lebeaux, Lidwine Trouilh, and Christophe Délye. n.d. “Prevalence, Spatial Structure and Evolution of Resistance to Acetolactate-Synthase (ALS) Inhibitors and 2,4-D in the Major Weed Papaver Rhoeas (L.) Assessed Using a Massive, Country-Wide Sampling.” Pest Management Science n/a (n/a). Accessed November 20, 2023. doi:10.1002/ps.7791.
Verdier-Metz, Isabelle, Céline Delbès, Matthieu Bouchon, Etienne Rifa, Sébastien Theil, Frédérique Chaucheyras-Durand, Eric Chevaux, Lysiane Dunière, and Christophe Chassard. 2023. “Dietary Live Yeast Supplementation Influence on Cow’s Milk, Teat and Bedding Microbiota in a Grass-Diet Dairy System.” Microorganisms 11 (3): 673. doi:10.3390/microorganisms11030673.
Mervant, Loic, Marie Tremblay-Franco, Maiwenn Olier, Emilien Jamin, Jean-Francois Martin, Lidwine Trouilh, Charline Buisson, et al. « Urinary Metabolome Analysis Reveals Potential Microbiota Alteration and Electrophilic Burden Induced by High Red Meat Diet: Results from the French NutriNet-Santé Cohort and an in Vivo Intervention Study in Rats ». Molecular Nutrition & Food Research n/a, nᵒ n/a (s. d.): 2200432. doi:10.1002/mnfr.202200432.
Guéraud, Françoise, Charline Buisson, Aurélie Promeyrat, Nathalie Naud, Edwin Fouché, Valérie Bézirard, Jacques Dupuy, Pascale Plaisancié, Cécile Héliès-Toussaint, Lidwine Trouilh et al. « Reduction, Removal or Replacement of Sodium Nitrite in a Model of Cured and Cooked Meat: A Joint Evaluation of Consequences on Microbiological Issues in Food Safety, Colon Ecosystem and Colorectal Carcinogenesis ». bioRxiv, 25 mars 2023. doi:10.1101/2023.03.24.531666.

Remerciement & citations

Philippon, Timothé, Fatima-Zahra Ait-Itto, Alicia Monfort, Frédéric Barrière, et James A. Behan. « Fe(III) Oxide Microparticles Modulate Extracellular Electron Transfer in Anodic Biofilms Dominated by Bacteria of the Pelobacter Genus ». Bioelectrochemistry 151 (1 juin 2023): 108394. doi:10.1016/j.bioelechem.2023.108394.
Fournier, Elora, Jeremy Ratel, Sylvain Denis, Mathilde Leveque, Philippe Ruiz, Carine Mazal, Frederic Amiard, et al. « Exposure to Polyethylene Microplastics Alters Immature Gut Microbiome in an Infant in Vitro Gut Model ». Journal of Hazardous Materials 443 (5 février 2023): 130383. doi:10.1016/j.jhazmat.2022.130383.
Lepesant, Julie M J, Carole Iampietro, Eugenia Galeota, Benoit Augé, Marion Aguirrenbengoa, Clemèntine Mercé, Camille Chaubet, et al. « A dual role of dLsd1 in oogenesis: regulating developmental genes and repressing transposons ». Nucleic Acids Research 48, nᵒ 3 (20 février 2020): 1206‑24. doi:10.1093/nar/gkz114.
Guyet, Ulysse, Ngoc A. Nguyen, Hugo Doré, Julie Haguait, Justine Pittera, Maël Conan, Morgane Ratin, et al. « Synergic Effects of Temperature and Irradiance on the Physiology of the Marine Synechococcus Strain WH7803 ». Frontiers in Microbiology 11 (2020). doi:10.3389/fmicb.2020.01707.
O’Donohue, Michael, Laurence Fournaison, et Mélanie Delclos. « Division of Science for Food, Bioproducts and Waste TRANSFORM ». Report, INRAE, 2020. doi:10.15454/f6h4-fp08.
Fournier, Elora, Mathilde Leveque, Philippe Ruiz, Jeremy Ratel, Claude Durif, Sandrine Chalancon, Frederic Amiard, et al. « Microplastics: What Happens in the Human Digestive Tract? First Evidences in Adults Using in Vitro Gut Models ». Journal of Hazardous Materials 442 (15 janvier 2023): 130010. doi:10.1016/j.jhazmat.2022.130010.
Autres publications ...

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  • photo ID
    Marie Ange Teste Responsable Plateforme
    Biologiste
  • photo ID
    Lidwine Trouilh Séquençage et Responsable qualité
    Biologiste
  • photo ID
    Nathalie Marsaud Séquençage et dPCR
    Biologiste
  • photo ID
    Jean-Luc Parrou R&D et dPCR
    Biologiste
  • photo ID
    Delphine Labourdette Analyses bioinformatiques et statistiques
    Bioinformaticienne
  • photo ID
    Etienne Rifa Analyses bioinformatiques et statistiques
    Bioinformaticien

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135, avenue de Rangueil
31077 Toulouse Cedex 4 - France

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